He investigado un poco más y ya sé no solo que está prohibido sino porqué se prohibió.
Lo explica muy bien de forma tangencial en este video un guiri.
https://www.youtube.com/watch?v=U-Vs04y174AAl parecer dejar la alineación en blanco y dejar que el entrenador decida optimiza de tal forma la alineación que está completamente roto y decidieron que solo se pueden dejar en blanco dos de los 5 titulares.
De todas formas sigo teniendo dudas de como funciona exactamente lo de usar o no al entrenador asistente así que como recomiendan en el video me pondré a hacer ensayos en los BMM y amistosos que se me pongan a tiro.